2000版的ISO9004标准的应用依据ISO9004标准的内容特色，可以在如下三个方面发挥作用：
1、处建立
ISO9001质量管理体系的组织，首先严格按照ISO9001:2000标准的要求进行策划、建立、实施，使ISO9001质量管理体系符合要求：由于ISO9004:2000规定了更为详尽的要求，同时推荐了很多可操作性的方法，因而了解并有选择地借鉴采用了ISO9004:2000标准的内容是“多快好省”建立
ISO9001质量管理体系的重要手段。
2、获证组织进一步健全改进ISO9001质量管理体系的有效途径
已经获得ISO9001认证证书的组织，通过理解并应用ISO9004:2000标准，可以进一步健全改进ISO9001质量管理体系，全面提高组织的总体业绩。应用时要结合本组织实际决定实施方案，一般应作以下方面工作：
(1)对照ISO9004:2000标准给出的指南，依次识别和确定自实施ISO9001中尚未涉及的过程和领域，补充到已有的过程网络中去。
(2)对拓展的新过程的控制准则和方法予以规定，明确这些过程的职责，补充必要条件。
(3)培训与拓展的新过程有关的员工。
3、对建立质量、环境和职业健康安全管理体系有重要参考作用。
由于ISO9004:2000标准的目标是追求广义的质量(包含产品和过程的环境、安全指标)、使所有相关方(包括员工、社会和环境的保护)受益和提高组织的整体业绩(包括资源的有效利用、成本降低、工伤事故的减少等)，而且其标准内容多处涉及环境、职业健康安全的具体要求，因而它的思路和方法对组织建立环境、职业健康安全管理体系亦有一定的参考价值。特别对于那些已通过
ISO9001认证的组织，在进一步建立质量、环境和职业健康安全管理体系时具有重要参考作用。
