1.目的不同，内部审核的目的是确定满足审核准则的程度，而管理评审的目的是要确保质量管理体系持续的适宜性、充分性和有效性。
2.对象不同，内部审核的对象是组织的质量管理体系，而管理评审的对象是组织的质量管理体系（包括质量方针和质量目标）
3.评价的依据不同，内部审核的评价依据是审核准则（包括ISO9001：2008），而管理评审的评审依据是顾客的期望和要求。
4.实施者不同，内部审核的实施者是审核员，而管理评审的实施者是最高管理者和管理层人员。
5.方法不同，内部审核的方法是系统、独立地获取客观证据，与审核准则对照，形成文件化的审核发现和结论的检查过程。而管理评审的评审依据以质量方针、目标及顾客需求，对质量管理体系的适宜性、充分性和有效性进行评价。
6.对输出结果的要求不同，内部审核的对输出结果应对质量管理体系是否符合要求，以及是否有效实施和保持作出结论，并形成记录。而管理评审应对质量管理体系的持续的适宜性，充分性和有效性，体系的变更、过程和产品的改进，资源的需求，包括质量方针和目标作出评价，并形成记录。
