1.由于我国经济、技术、管理水平普遍落后，资金有限，环保任务很重，故实行iso14000的速度和规模将大大滞后，这将直接影响我国产品的成本、市场准入和竞争力。
2.实行iso14000标准及认证的费用压力大，中、小企业无力承受，势必影响我国的对外贸易。
3.目前已通过iso14000认证的企业，其规模都较大，但在进行环境认证时，会遇到一些困难，审核范围不易确定，管理责任不易界定；企业机构调整后，环境责任未理顺；环境目标管理与企业经营、技术等目标分离；基础设施薄弱，设备陈旧，难以保证环境因素得到有效控制；有害废弃物的存放要求、处理手段不健全。
需要说明的一点是，中国的GBT14000系列标准是等同采用iso14000标准的，这样照搬过来，是否完全符合中国的国情和中国企业的环保实际，还有待商榷。根据我国环境问题突出的情况，要坚决防止以获得证书为目的的环境欺骗行为，建立自愿性认证和强制性认证相结合的体制，对污染严重、环境危害大的企业，必须由政府执行强制性的生态认证，并进行严格的环境监督。
