在质量管理体系认证过程中，绝大部分企业只在意获得质量管理体系认证证书，而不在意、不理解、不投入提高质量管理体系运行的效率和效益，甚至把质量体系管理实际作为附属部门对待，使中层管理人员和广大员工对质量体系规范工作产生抵触情绪，大家还是随心所欲的工作，大事小事领导说了算，根本不按照程序操作。这样便导致了质量管理体系的 “两张皮”现象，建立的体系与实际运行不符。
因此企业要避免质量管理体系的两张皮，首先要求认真执行质量管理体系内审工作，打破每年进行的较短时间的集中内审，只要保证每个年度的内审覆盖到公司的每一部门和标准的全部条款，计划可以随时调整，薄弱环节能够及时增加审核频次，不符合项的跟踪验证能够成为日常的例行工作，使持续改进能自然地成为长效机制，这样员工就会思想上重视按体系文件要求照章办事了。
其次将审核发现、顾客抱怨同企业绩效改善联系起来，综合评估成本、机会和风险，对体系管理中带有普遍性的问题，要进行系统分析、识别产生的原因，并验证改进措施的有效执行和实现的增值效果。要对照问题的解决进行体系文件的规范性、适宜性的修编完善，促进企业生产率提高，最终实现提升绩效。
第三要加强培养企业员工的正确质量意识观念。
