关于成本的控制，上述企业对流程的策划和对不合格品的预防，目的之一就是减少不合格品，从而可以减少不良质量成本。
除此而外，本标准导入了精益制造的原则，目的之一也是控制成本。
精益制造原则要求企业不同部门具有相同的目标，即：为达到企业自身制订的成本目标而工作，控制成本的公式，从传统的模式：成本+利润=价格，或 价格-成本=利润，变成精益模式：价格-利润=成本，价格是市场导向的，不以企业思维而改变，利润是企业领导层制定的，是企业的战略之一，在一定的利润战略部署下，当价格变动时(通常是降价)，成本随之改变(通常要求减少)，那么企业各部门如何去做来保证成本控制在预期目标内呢？
这就是精益制造方法要去解决的问题。精益制造的理念是减少浪费，企业运行中的各种浪费，比如：生产搬运过多，废品的产生，更换模具时间太长，产品库存过多等等。任何的浪费得到解决或控制，都会使成本减少，问题是如何使浪费得到解决或控制呢？首先是观念，必须先有想去解决问题的观念，其次要具体问题具体分析，在本标准里也有些方法可以借鉴，比如要求顾客导向的生产计划，可以一定程度减少库存品过多；对厂房，设备和设施进行策划，可以减少过多搬运等等。
ISO/TS16949质量管理体系不是万能的，对不同企业的影响也有差异，企业也不可能指望实施了ISO/TS16949质量管理体系就万事大吉了，但求能够通过事实本体系能够比以前有一点进步，并坚持不懈，持续改进体系流程，从而达到最终目的。
