ISO9001:2008标准将赋予政府机关强大的管理再造和管理变革功能，有利于建立科学高效的管理体系，提高政府机关行政管理水平。
贯彻ISO9001标准，建立政府机关的质量管理体系，决不仅仅是将一种管理方法应用于政府机关的管理工作，而是政府管理体系的转型，是用一种新的管理体系代替老的管理体系，是涉及管理目标、管理制度、运行机制、责任结构以及组织文化的体系性变革与创新。这种变革的作用和意义是重大而深刻的。质量管理体系之所以具有这种改造和变革功能，原因有以下三点：
一、ISO9001标准是管理科学思想最新成果的结晶。质量管理体系的建立过程，就是现代管理思想的推广应用过程，它将促进政府机关管理思想的深刻变革。由于质量管理体系的“全员参与”性，它使组织的每个成员都成为现代管理思想的受益者，使人们不断摒弃传统的、落后的管理思想和思维方式，逐步确立现代管理科学思想和思维方式，从而为现代管理科学走进政府机关打开了大门，为将现代管理方法应于政府机关管理奠定基础。
二、ISO9001标准是近年来世界先进管理实践经验的科学总结。它包涵了众多的现代管理方式和管理技术。质量管理体系实际上就是现代管理方式和技术的集合。质量管理体系的建立，实际上就是把这些管理方式和技术应用于政府机关管理的工作实践，从而实现管理方式的创新与变革。
三、为构造新的运行机制提供了体系框架。所谓运行机制，是指一个体系中要素的作用关系和制约关系。每个体系的运行机制之所以不同，在于它的受控状态。质量管理体系遵照控制论的原理，形成了“预防为主”、“过程控制”、“全面受控”、“持续改进”为要件的运行机制体系框架，从而保证了每个组织按照这一框架，都可以建立起有效控制的运行机制。
由于具有这种体系性功能，质量管理体系将会产生良好的效果：
有利于提高政府机关管理水平和工作效率，建立起职责明确、程序规范、流程顺畅、高效运转、全面受控的管理体系，改变基础管理薄弱、推诿扯皮、管理粗放等状况，促进政府机关管理工作由经验型、人治化、随意性向制度化、规范化、标准化转变。
有利于加强政府管理和行政管理管理，建立“讲究效率、文明服务、公正执法、不断改进”的业务管理模式，提高税收征收管理和税收行政管理的整体绩效。
有利于根据顾客需求的变化和社会发展的要求，不断改进工作，发现问题，寻找机会，持续改进，创新管理，创新服务，从而不断地创造新业绩，创建新优势。
