第一阶段审核的是体系的总体策划情况，是体系基础性、方向性的审核。
第二阶段审核的是体系的运行情况，只有策划有效、基础充分、方向无误的体系运行才有可能是有效的。两个阶段审核互相补充，不可替代，共同支撑保证审核的深度和有效性。
因此，体系文件的符合性，环境因素识别的充分性，重大环境因素评价的适宜性，法律法规的符合性，法律法规相应内容识别的适宜性、组织机构的适宜性和充分性，重大环境因素控制条款的一致性，内审和管理评审的可信度和充分性等都是在一阶段审核的对象及评价的内容。
把握以上内容审核，即把握住了第一阶段审核的侧重点，将为审核的有效性打下基础。
