1目标不同
GB/T 45001-2020以消除或尽可能降低可能暴露于与组织活动相关的职业健康安全危险源中的员工和其他相关方所面临的风险为目标,针对所有影响员工和相关方的安全和健康风险，没有明确风险的类别和程度;而GB/T 39001-2019以减少和消除道路交通事故造成的重伤和死亡为目标，对于除道路交通伤害以外的风险并不关注，而且轻伤和车辆刮蹭也不作为控制的目标，这就为风险和绩效因素的识别缩小了范围，突出了控制的重点。
2适用范围不同
(1)GB/T 45001-2020适用于任何类型和规模的组织，包括不同的地理、文化和社会条件的组织，对风险的管理更具有普遍性和通用性;而GB/T 39001-2019是专门针对与道路交通系统相互影响的公共和私人组织，对道路交通安全的风险管理更具有针对性。
(2)GB/T 45001-2020明确了所涉及的风险仅限于组织的活动、设备和场所;而GB/T 39001-2019强调道路交通系统是一个开放的系统，要考虑组织能够影响或能够被影响的道路交通系统的人、车、路和环境的各个方面，所以既包括组织自身的道路交通活动、车辆、场所，也包括涉及到道路交通安全的组织的产品和服务，如:车辆的设计、制造、维修保养;道路的设计、建设和维修保养;道路安全设备设施的设计、制造和维护;医疗救护;道路交通安全执法和监督管理等。
