对公司现行的四标管理体系进行整合研究，最终要形成一套协调一致的体系文件，而体系文件主要包括方针目标、管理手册、程序文件、作业文件和运行记录等五方面内容，其中，基于过程方法对程序文件和作业文件进行一体化整合是必须要进行的，运行记录则是体系在运行过程中自然产生的，程序文件、作业文件、运行记录的一体化整合尽管工作量巨大，但脉络非常清晰。总体方针和目标可以根据各标准不同的要求分别制定，也可以合并制定，无论如何制定，不影响整合管理体系的运行，只需放在同一份文件中即可。
管理手册的一体化整合，则相对比较复杂，因为管理手册是将SO标准与公司文件相互结合的桥梁，相当于公司体系文件中的“宪法”，是最主要的纲领性文件。管理手册往往要按照标准的具体条款来对应描述，而且，经常需要向外部提供，能够让第三方组织或相关方快速地了解公司管理体系总体状况，如果将四种标准整合成一套管理手册，尽管可以减少文件数量，有利于建立协调一致的文件，但面临工作量大、整合困难、外部接受度不高等问题，所以，如何对管理手册进行一体化整合，是一个比较棘手的问题。
经过公司体系运行专家组研究，提出对管理手册进行整合的三种方案如下：
(1)两标手册整合将质量管理体系和环境管理体系的手册进行整合，投诉处理体系和知识产权管理体系的管理手册以单独的形式出现。由于质量管理体系和环境管理体系运行结构基本相同，在四种体系标准中最为接近，经过在公司内多年的运行，内部员工接受度较高，尽管一体化整合的幅度较小，但运行相对容易，工作量也较小，缺点是一体化整合的程度不足。
(2)三标手册整合将质量管理体系、环境管理体系、投诉处理体系这三个标准的管理手册进行一体化整合，知识产权管理体系的管理手册单列，这是一种折中的方案。投诉处理体系与质量管理体系关联度较大，与质量、环境管理体系进行一体化整合的难度相对较小。缺点在于未能进行彻底的一体化整合，对于体系运行的效率还是会产生一定的影响。
(3)四标手册整合将质量管理体系、环境管理体系、投诉处理体系、知识产权管理体系的四标管理手册进行彻底的一体化整合，优点是整合彻底，有利于形成统一的思路，形成统一的文件，有利于最大程度地提高效率，缺点是内部接受度和外部接受度都存在一定的障碍，而且，知识产权管理体系与其他三个体系的管理手册整合难度相对比较大，各认证机构接受难度较大。
如何在以上三个方案中进行选优决策难度较大，仅仅凭经验拍脑袋判断难以保证方案的科学性，因而寻找一种相对科学可靠的方法进行决策选优就成为必然。
