（1）强制性差异。
安全生产标准化建设是贯彻国家安全生产法律、法规、标准要求，安全生产标准化是管理标准，是政府的强制行为，采取强制原则；职业健康安全管理体系是管理方法，职业健康安全管理体系认证为组织的自愿行为，采取自愿原则。
（2）适用范围不同。
安全生产标准化是国家针对相应行业的企业制定的，采取不同的行业适用不同的考评标准，其内容与行业标准、企业实际相对应，属于有限适用。根据原《企业安全生产标准化基本规范》（AQ/T9006-2010）要求编制的“工贸企业安全生产标准化基本规范评分细则”中对于冶金、有色、建材、机械、轻工、纺织、烟草、商贸等行业企业开展安全生产标准化自评、申请、外部评审的要求分别进行了明确。其中以建材行业为例，印发了水泥、石膏板、平板玻璃和建筑卫生陶瓷等4个专业评定标准。水泥企业安全生产标准化评定标准有13项考评类目（A级元素）、47项考评项目（B级元素）和187条考评内容（核心内容），共计660分。平板玻璃企业安全生产标准化评定标准分为13项考评类目、46项考评项目和172条考评内容，共计660分。建筑卫生陶瓷企业安全生产标准化评定标准分为13项考评类目、46项考评项目和175条考评内容，共计660分。石膏板企业安全生产标准化评定标准分为13项考评类目、47项考评项目和217条考评内容，共计1000分（注行业安全标准化评审，目前按现有标准评定，新的尚在制定中，请遵从有效版本进行评审。）。
而职业健康安全管理体系适用范围广，适用于各类有建立体系愿望的组织，可以是企业、机构，甚至是一个区域管理范畴。体系标准内容广泛适用。
（3）侧重点不同。
安全生产标准化是一个考评体系，以隐患排查治理为基础，预警预测为抓手，更加重视可操作性和实效性，特别是生产现场的实际效果和状态。主要是考核具体管理过程的结果，包括基础管理、设备设施、作业环境和职业健康等各具体管理的结果。采用的是评分制，是一个量化标准。职业健康安全管理体系强调的管理模式和方法，注重流程、强调方法。以危险源辨识、风险评价和控制为基础，侧重于管理体系框架的构建，管理流程的设计和规范，更注重过程持续推进，未提出量化的指标。
（4）审核和考评方法不同。
安全生产标准化是有起点要求的，有量化的考评细则，实行分级评定；而职业健康安全管理体系是没有起点要求的，无统一的考评细则，无分级。安全生产标准化实行自主评定、外部评审的方式。由生产经营单位指定有资质的评审单位对企业开展评审，采用评分制，分3档
达标（一级90分、二级75分、三级60分），一级最高，如达不到60分，就不能达标，同时设置否决项，对安全绩效有明确要求，一旦发生安全事故，将直接影响评定结果。
职业健康安全管理体系主要强调系统化的健康安全管理思想，即通过建立一整套职业健康安全保障机制，旨在控制和降低职业健康安全风险并改进其绩效，最大限度地减少安全事故和职业病的发生。它并未提出具体的职业健康安全绩效准则，也未明确涉及管理体系的具体规定，也就是说不管这个企业是事故低发单位，还是事故高发、频发单位，都可以建立体系。由企业自主选择有资质的评审单位实施认证活动。综上所述，虽然安全标准化或职业健康安全管理体系的审查程序不同，所需要的资料等也不尽相同；但它们均具有系统化、结构化、程序化和文件化的特点，同时均突出强调了最高管理者的承诺和责任及全员参与，以及全过程控制和持续改进的原则。职业健康安全管理体系的控制范围强调作业场所内的人员安全和健康，而安全生产标准化的控制范围，除了关注作业现场的人员安全和健康外，还考虑生产经营过程事故造成的财产安全问题、防灾减灾问题和交通安全问题，以及生产安全事故对作业现场外部的影响等。但两者的最终目标是一致的，即实现安全生产和员工健康。所以若能将二者融合为一体，合并同类项，化繁为简，不仅能减轻工作量，提供工作效率，同时对企业内部安全管理而言也能达到1＋1≥2的效果。
