当前安全生产标准化推进中的核心问题有两个：一是企业选用哪一个标准﹔二是如何克服运行中的两张皮情况。
企业安全生产标准化建设可选择标准有《企业安全生产标准化基本规范》等系列安全标准化规范、《GB/T28001职业健康安全管理体系规范》、OHSAS18001、南非NOSA五星或企业自身开发的安全管理体系（如杜邦、壳牌、中石油、中石化的HSE）等。
国际上主要的安全管理体系都来自于企业的探索实践，经总结提炼为推荐性标准，遵循系统理论，基于风险管理和预防为主，按照戴明循环搭建结构，强调守法，追求持续改进，为企业全面系统的安全管理提供有力指导，是企业安全生产长效机制建设的核心和主要手段。
《AQ/T9006-2010企业安全生产标谁化基本规范》等安全生产标准化规范，本质也属于职业安全健康管理体系的一种，是管理类推荐性标准。在市场经济社会中企业拥有自主管理权，选取什么管理模式、方法和工具是企业自主决定的，政府部门只能依法监督企业是否遵守法律法规和强制性标准，而对于具体管理模式和方法，政府部门可倡导和推荐，但不能强制执行。企业既可选择《企业安全生产标准化基本规范》等系列安全标准化规范，也可选择《GB/T28001职业健康安全管理体系规范》、OHSAS18001、南非NOSA五星或企业自身开发的安全管理体系，只要能有效贯彻执行国家安全生产、职业健康法律法规和强制性标准即可。
两张皮是相当一部分企业实际存在的问题，这也说明从传统的经验管理过渡到系统科学管理中面临的挑战。一些企业在安全生产标准化建设中主要精力用于建立文件化的管理体系，而文件体系复杂，不便于使用者执行，陷于繁琐的记录。有的领导认为体系的创建无非就是编制一套文件，狭隘肤浅的认识导致创建走过场搞形式，管理人员在体系设计阶段不注重总体规划，急于求成，图省事走捷径，一线员工参与不够，最终形成的制度与企业实际脱节，不能解决企业安全工作中的实际问题。
